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          我校亞熱帶生物多樣性實驗室在水稻基因組結構變異研究中取得新進展

          發布者:gaoyun發布時間:2020-11-04瀏覽次數:478

               我校亞熱帶生物多樣性實驗室寇一翾博士與美國加州大學歐文分校的科學家合作,在水稻群體進化基因組學研究方面取得新進展,研究成果以亞洲稻馴化中結構變異的演化基因組研究(Evolutionary Genomics of Structural Variation in Asian Rice (Oryza sativa) Domestication為題,于2020718日在《分子生物與進化》(Molecular Biology and Evolution)上在線發表??芤宦Q博士為該文第一作者。

              結構變異作為基因組變異的重要組成部分,對植物表型變異產生了巨大的影響,并在生產實踐中得到了廣泛的應用,然而從群體基因組水平上深度揭示其變化規律的研究甚少。該文以亞洲栽培稻Oryza sativa與其野生祖先種O. rufipogon為研究對象,基于基因組重測序數據(347份材料),以及三代和組裝基因組數據,鑒定了水稻群體基因組水平上的結構變異,包括倒位、重復、刪除、易位,以及轉座元件;通過位點頻譜變化規律和遺傳負荷分析,揭示結構變異作用于水稻的馴化成本(domestication cost),并主要以有害突變的形式存在,尤其是倒位和轉座元件SINEmariner家族;此外,通過比較基因組分析發現,在水稻馴化過程中通過結構變異獲得和丟失數百個基因,在一些顯著分化的結構變異中還富集了一批與重要的農藝性狀相關的基因。該研究不僅對水稻遺傳育種具有重要的指導意義,同時也為植物馴化相關的研究,以及植物群體進化基因組學研究提供新的研究思路。

              我校亞熱帶生物多樣性實驗室自2007年成立以來,先后承擔科研項目20余項,其中國家自然科學基金15項,在Molecular Biology and Evolution等國際著名學術刊物上發表相關研究成果近30篇,獲2019年度江西省自然科學一等獎,為我校植物學、生態學和林學等學科發展提供了支撐。


          文章鏈接:https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msaa185/5873527?searchresult=1

                  

          供稿:農學院  審核:科技處


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